Пётр I собирал и покупал во время своих заграничных поездок зоологические, анатомические и исторические экспонаты.
Позже он издал указ сдавать в музей все обнаруженные "необычные вещи", "кости человеческие и скотские, рыбьи или птичьи, не такие, какие у нас ныне есть", за это полагалось вознаграждение, а за утаивание - огромный штраф. Коллекция быстро пополнялась, многое привозилось из экспедиций Академии наук, учреждённой Петром на базе музея.
Для того, чтобы вместить все экспонаты, было построено собственное здание музея.
Тут можно посмотреть чучело двухголового телёнка и небольшую зоологическую коллекцию чучел.
Здесь можно увидеть головные уборы индейцев и летопись, нарисованную на шкуре бизона, африканские маски, монгольскую юрту, шаманскую флейту из кости человека, самурайские доспехи и мечи, китайский солнечный чайник, древнее оружие и украшения
Это заводной кораблик тонкой работы, на нём фигурки музыкантов и танцовщиц, вырезанные из слоновой кости.
Изначально фигурки танцевали и исполняли музыку, но починить 300-летний механизм не удалось.
Это один из первых экспонатов коллекции, привезённой ещё Петром 1.